依「國立中興大學秘書室設置辦法」第二條規定 本室設下列單位：
行政議事組：綜理公文審閱、校務會議及行政會議辦理、分層負責制度推動、文牘議事及校印掌理相關事宜。
媒體公關組：綜理媒體輿情搜集、新聞發佈及媒體公關相關事宜。
文書組：綜理收發文、檔案管理、郵件處理及文書檔案相關事宜(97年5月9日第54次校務會議決議調整文書組改隸秘書室，教育部97年6月30日核備後實施）。
校友中心：綜理校友服務、校友會連絡、傑出校友表揚及校務基金捐贈等相關事宜(108年12月20日第87次校務會議決議將校友中心整併納入秘書室，自109年2月1日起實施）
本室各單位除前述業務外，並辦理本校上級交辦各相關業務。
| 電話 | 04-22840605 |
|---|---|
| 電子郵件 | yslee@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
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| 代理人 | 1.石文宜、2. 陳曜堡 |
| 電話 | 04-22840204 或22840603 轉2 |
|---|---|
| 電子郵件 | wenyi451@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
|
| 代理人 | 1.陳孟玉、2.陳曜堡 |
| 電話 | 04-22840204 或2840603 轉4 |
|---|---|
| 電子郵件 | chen0220@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
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| 代理人 | 1.鄭志學、2.石文宜 |
| 電話 | 04-22840604 |
|---|---|
| 電子郵件 | moon@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
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| 代理人 | 1.石文宜、2.陳曜堡 |
| 電話 | 04-22840204 或22840603 轉5 |
|---|---|
| 電子郵件 | cch602@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
|
| 代理人 | 1.陳曜堡、2.陳孟玉 |
| 電話 | 04-22840604 |
|---|---|
| 電子郵件 | cchu20156@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
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| 代理人 | 1.陳孟玉、2.石文宜 |
| 電話 | 04-22840602 |
|---|---|
| 電子郵件 | shan66330@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
|
| 代理人 | 1.鄭志學、2.陳孟玉 |