依「國立中興大學秘書室設置辦法」第二條規定 本室設下列單位：
行政議事組：綜理公文審閱、校務會議及行政會議辦理、分層負責制度推動、文牘議事及校印掌理相關事宜。
媒體公關組：綜理媒體輿情搜集、新聞發佈及媒體公關相關事宜。
文書組：綜理收發文、檔案管理、郵件處理及文書檔案相關事宜。
校友中心：綜理校友服務、校友會連絡、傑出校友表揚及校務基金捐贈等相關事宜(108年12月20日第87次校務會議決議將校友中心整併納入秘書室，自109年2月1日起實施）
本室各單位除前述業務外，並辦理本校上級交辦各相關業務。
| 電話 | 04-22840535 |
|---|---|
| 電子郵件 | jsleu@nchu.edu.tw |
| 職掌 |
|
| 代理人 | 1.鄭文秀、2.曾麗芳 |
| 電話 | 04-22840616 |
|---|---|
| 電子郵件 | j4138@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 總發文、檔案管理：
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| 代理人 | 1.楊妤庭、2.曾麗芳 |
| 電話 | 04-22840257 |
|---|---|
| 電子郵件 | chen0220@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 總收文、省紙計畫、本組庶務窗口：
|
| 代理人 | 1.蕭名君、2.蕭秋萍 |
| 電話 | 04-22840259 |
|---|---|
| 電子郵件 | sophia@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 檔案管理：
|
| 代理人 | 1.蕭秋萍、2.曾麗芳 |
| 電話 | 04-22840259 |
|---|---|
| 電子郵件 | sany0702@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 總發文、檔案管理：
|
| 代理人 | 1.鄭文秀、2.楊妤庭 |
| 電話 | 04-22840566 |
|---|---|
| 電子郵件 | cphsiao1012@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 公文系統維護、公文時效管考、本組網管：
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| 代理人 | 1.陳汶瑄、2.鄭文秀 |
| 電話 | 04-22840256 |
|---|---|
| 電子郵件 | yuting717@dragon.nchu.edu.tw |
| 職掌 | 總發文、檔案管理：
|
| 代理人 | 1.曾麗芳、2.鄭文秀 |
| 電話 | 04-22840257 |
|---|---|
| 電子郵件 | alita0924@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 紙本總分文：
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| 代理人 | 1.陳曜堡、2.蕭秋萍 |
| 電話 | 04-22840258 |
|---|---|
| 電子郵件 | li-jung@nchu.edu.tw |
| 職掌 | 郵件收發：
|
| 代理人 | 1.黃宏達、2.石金英 |
| 電話 | 04-22840258 |
|---|---|
| 電子郵件 | hhonda77@yahoo.com |
| 職掌 | 郵件收發：
|
| 代理人 | 1.石金英、2.盧麗蓉 |
| 電話 | 04-22840258 |
|---|---|
| 電子郵件 | shykeiyi@dragon.nchu.edu.tw |
| 職掌 | 郵件收發：
|
| 代理人 | 1.盧麗蓉、2.黃宏達 |