由11所國立大學組成的「臺灣國立大學系統」，110年2月由教育部正式核定通過，是全臺規模最大的高教聯盟。今（2024）年下半年，國立金門大學、國立東華大學與臺北市立大學也將加入，成員數增加至14校，臺灣國立大學系統運作至今，在教學、研究、課程及體育方面皆有密合的交流，藉由聯盟的資源共享，提供學子更優質的學習環境。
臺灣國立大學系統由中興大學號召成立，系統成員校包含中興大學、聯合大學、台灣體育運動大學、勤益科技大學、台中教育大學、彰化師範大學、暨南國際大學、雲林科技大學、虎尾科技大學、嘉義大學、高雄大學，以及今年度將加入的國立金門大學、國立東華大學與臺北市立大學。
臺灣國立大學系統8月20日召開系統委員會議，東華大學徐輝明校長、林楚軒研發長與金門大學代表吳佳駿組長、臺北市立大學邱英浩校長與郭晉銓主任秘書一同出席會議，系統成員校熱烈歡迎三校加入。俟臺北市立大學10月下旬校務會議通過後，全案將報教育部核定，共同為高教永續發展而努力。
系統主席、興大校長詹富智表示，該系統囊括臺灣北中南東及離島金門的大學，有研究型大學、教學型大學、技職體系大學及體育單科校院，期許透過各成員校之特色，打造出不同於以往的高教生態，吸引更多學子就讀。期望藉由系統的運作，整合各校資源，提升教師教學研究品質，朝向跨校、跨領域、跨專業的多元融合，提前掌握未來教育潮流。
目前臺灣國立大學系統成立7大工作圈，研發工作圈首推「學生實驗室交換計畫」，深獲學子的肯定，自111年以來，從37名學生申請增加至65名學生申請，年成長75%；同時也鼓勵年輕學者申請跨校整合計畫，兩年來共有46件申請，每件核定通過的計畫補助約40~50萬元，透過此計畫，媒合跨校研究人才，以培育未來跨校研究團隊。此外，教學工作圈在課程共享、教學知能及跨校輔系、雙主修等業務推動上皆獲不錯的反應；為培養學生具備第二專長與多元能力，今年也將討論合作開設跨校學分學程，提供系統學生修習，以利未來職涯規劃。今年甫成立的體育工作圈，將由成員校：臺灣體育運動大學於明年規劃辦理系統籃球/排球聯賽，藉由多面向的交流，提升聯盟學校師生間的情誼。